植物學(xué)課題組簡(jiǎn)介

發(fā)布日期:2024-09-19 點(diǎn)擊數(shù):

1.團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人:

團(tuán)隊(duì)成員:

3.研究方向:

方向一:植物環(huán)境適應(yīng)背后的分子機(jī)制

研究?jī)?nèi)容:30多年來(lái),我們對(duì)植物細(xì)胞的觀察發(fā)現(xiàn)了兩個(gè)有趣的現(xiàn)象:第一是植物線粒體基因組的低拷貝性,即細(xì)胞中大多數(shù)線粒體不攜帶DNA,平均十個(gè)線粒體共享一套基因組信息;第二是被子植物在系統(tǒng)演化中出現(xiàn)了較高比例的質(zhì)體基因組父系傳遞。有趣的是這兩個(gè)現(xiàn)象的背后分別隱含著線粒體和質(zhì)體基因組與細(xì)胞核基因組之間的大面積核質(zhì)沖突。植物依靠上述兩個(gè)現(xiàn)象克服了獨(dú)特的核質(zhì)沖突而演化至今。動(dòng)物中未見(jiàn)上面的現(xiàn)象和相應(yīng)的核質(zhì)沖突,說(shuō)明植物細(xì)胞在陸生生長(zhǎng)過(guò)程中經(jīng)歷的逆境脅迫遠(yuǎn)強(qiáng)于動(dòng)物細(xì)胞,致使其線粒體和質(zhì)體基因組發(fā)生了更多的遺傳變異,從而與細(xì)胞核的共進(jìn)化更為復(fù)雜。本實(shí)驗(yàn)室后續(xù)將針對(duì)上面兩個(gè)現(xiàn)象背后的分子機(jī)制進(jìn)行深入的研究。

方向二:藥用特色植物的生物合成調(diào)控與種質(zhì)創(chuàng)新

云南是我國(guó)生物多樣性最豐富的地區(qū)之一,擁有大量珍稀藥用植物,如三七、天麻、重樓、蒲公英等,其活性成分(如皂苷、生物堿、黃酮、天麻素等)在醫(yī)藥和保健品領(lǐng)域具有重要價(jià)值。研究這些藥用植物的生物合成與調(diào)控機(jī)制,解析關(guān)鍵代謝通路及調(diào)控網(wǎng)絡(luò),有助于通過(guò)基因工程手段提高目標(biāo)成分產(chǎn)量。同時(shí),結(jié)合種質(zhì)創(chuàng)新技術(shù),可培育優(yōu)質(zhì)、高產(chǎn)、抗逆的新種質(zhì)資源。此外,云南高原環(huán)境下的逆境脅迫(如干旱、低溫)顯著影響藥用植物的次生代謝,研究其響應(yīng)機(jī)制可為抗逆品種選育提供理論依據(jù)。未來(lái)研究方向聚焦:① 藥用植物合成生物學(xué)與異源表達(dá)體系的構(gòu)建;② 多組學(xué)整合分析挖掘關(guān)鍵功能基因;③ CRISPR/Cas9等基因編輯技術(shù)定向改良藥用性狀;④ 逆境脅迫與藥用成分合成的互作機(jī)制。該研究對(duì)云南特色藥用植物的資源保護(hù)與可持續(xù)利用具有重要意義。

方向三:植物發(fā)育的分子機(jī)制

新性狀和(新)適應(yīng)性的進(jìn)化是生物表型多樣化形成的關(guān)鍵,也是生物從簡(jiǎn)單到復(fù)雜進(jìn)化的基礎(chǔ)。花作為被子植物的一個(gè)關(guān)鍵創(chuàng)新性狀,在被子植物的多樣化形成和維持過(guò)程中有重要作用。花和被子植物的起源以及快速演化問(wèn)題也被達(dá)爾文稱為“惱人之謎”。在前期研究中,我們發(fā)現(xiàn)植物從簡(jiǎn)單到復(fù)雜,從水生到陸生過(guò)程中,一些代謝途徑(例如MEP和MVA途徑)的逐漸形成和多樣化可能在植物的水陸轉(zhuǎn)化過(guò)程中有重要作用。例如,MEP途徑中間代謝物MEcPP 介導(dǎo)的葉綠體逆行信號(hào)參與了早期陸生植物小立碗蘚對(duì)熱脅迫的耐受性和生長(zhǎng)調(diào)控(圖1A, B)。

花器官這一結(jié)構(gòu)的出現(xiàn),從進(jìn)化角度看是典型的性狀創(chuàng)新,闡明花器官結(jié)構(gòu)多樣性形成的機(jī)制對(duì)于理解被子植物和花多樣性的演化至關(guān)重要。在花器官中,由萼片或花瓣形成的距也在植物的多樣化和適應(yīng)性中發(fā)揮重要作用(圖1C),大彗星蘭擁有的長(zhǎng)距和非洲長(zhǎng)喙天蛾長(zhǎng)長(zhǎng)的喙便是這種協(xié)同進(jìn)化和相互適應(yīng)的經(jīng)典案例。有些植物擁有一個(gè)距(例如,大彗星蘭和鳳仙花等),有些植物擁有多個(gè)距(例如,耬斗菜),但距是如何進(jìn)化出來(lái)的?控制它的身份和數(shù)目決定的基因是什么仍然不是很清楚?在前期我們?cè)邙P仙花中獲得了一些單距、雙距和三距的植物材料,所以,我們將用這些材料來(lái)解析鳳仙花中距的身份和數(shù)量決定的科學(xué)問(wèn)題(圖1D)。本方向?qū)⒁栽缙陉懮参镄×⑼胩\和地錢(qián)以及西南地區(qū)特色植物作為實(shí)驗(yàn)體系,從分子生物學(xué)角度探究植物(新)性狀或適應(yīng)性的產(chǎn)生機(jī)制及進(jìn)化范式,從而進(jìn)行特色植物/作物的性狀改良和智能植物設(shè)計(jì)。

             圖1植物的進(jìn)化發(fā)育(圖C改自Li等人的文章)

4.團(tuán)隊(duì)成果:

(1)承擔(dān)項(xiàng)目

國(guó)家磷資源開(kāi)發(fā)利用工程技術(shù)研究中心開(kāi)放基金,利用磷礦伴生鈣鎂礦物材料高效去除富營(yíng)養(yǎng)化水體中磷的研究

國(guó)家自科科學(xué)基金 ,基因工程改造蜜環(huán)菌提高天麻4-羥基苯甲醇和天麻素含量研究(31960071)

國(guó)家自然科學(xué)基金:S-亞硝基化介導(dǎo)SlMYB86調(diào)控番茄硝酸鹽脅迫抗性的分子機(jī)制(32260753)

國(guó)家自然科學(xué)基金:鳳仙花科滇水金鳳距發(fā)育的分子機(jī)制研究(32460059)

(2)發(fā)表論文專著

Zhang Q and Sodmergen (2010) Why does biparental plastid inheritance revive in angiosperms?J Plant Res123: 201-206.

Wang DY, Zhang Q, Liu Y, Lin ZF, Zhang SX, Sun MX, Sodmergen (2010)The levels of male gametic mitochondrial DNA are highly regulated in angiosperms with regard to mitochondrial inheritance.Plant Cell22: 2402-2416.

Ju Y, Guo L, Cai Q, Ma F, Zhu QY, Zhang Q, Sodmergen (2016)Arabidopsis JINGUBANG is a negative regulator of pollen germination that prevents pollination in moist environments.Plant Cell28: 2131-2146.

Ma F, Qi H, Hu YF, Jiang QR, Zhang LG, Xue P, Yang FQ, Wang R, Ju Y, Uchida H, Zhang Q,Sodmergen (2018)The mitochondrial endonuclease M20 participates in the down-regulation of mitochondrial DNA in pollen cells.Plant Physiology178: 1537-1550.

Zhang LG, Ma J, Shen ZR, Wang B, Jiang QR, Ma F, Ju Y, Duan GX, Zhang Q, Su XD, Sodmergen (2022) Low copy numbers for mitochondrial DNA moderates the strength of nuclear-cytoplasmic incompatibility in plants.Journal of Integrative Plant Biology65: 739-754.

Zhang LG, Ma F, Duan GX, Ju Y, Yu TQ, Zhang Q, Sodmergen (2024) MIKC*-type MADS transcription factors control JINGUBANG expression and the degree of pollen dormancy in Arabidopsis.Plant Physiology197: kiae576.

Xing Zhao, Jinlong Cai, Peng Xu, Zeyi Zhou, Caixia Guo, Hongjun Nian, Kunzhi Li*(2025)NAA enhances armillaria gallica growth by modulating nitrogen metabolism through AgZFP48,International Journal of Biological Macromolecules,140032

Yaqi Bi, Fuyan Jiang, Yudong Zhang, Ziwei Li, Tianhui Kuang, Ranjan K. Shaw, Muhammad Adnan, Kunzhi Li*, Xingming Fan*(2024) Identification of a novel marker and its associated laccase gene for regulating ear length in tropical and subtropical maize lines.Theoretical and Applied Genetics137: 294.

Xing Zhao, Xueting Yang, Yunfang Li, Hongjuan Nian, Kunzhi Li*(2023)14-3-3 proteins regulate the HCHO stress response by interacting with AtMDH1 and AtGS1 in tobacco and Arabidopsis.Journal of Hazardous Materials.458:132036.

Liu J, Wang C, Kong L, Yang Y, Cui X, Li K, Nian H*(2023). Rho2 involved in development, stress response and pathogenicity of Fusarium oxysporum.World J Microbiol Biotechnol39(10): 272.

Wen Z, Liu J, Li Y, Liu S, Nian H*(2022). Transcription factor Crz1 from Cryptococcus humicola conferred aluminum resistance and interacted with calcineurin.Curr Microbiol79(5):138.

Senlin Zeng, Xudong Sun, Jiali Zhai, Xixian Li, García-Caparrós Pedro, Hongjuan Nian, Kunzhi Li, Huini Xu(2024). SlTrxh functions downstream of SlMYB86 and positively regulates nitrate stress tolerance via S-nitrosation in tomato seedling.Horticulture Research

Xiaojun Pu?, Xiumei Dong?, Qing Li, Zexi Chen and Li Liu* (2021). An update on the function and regulation of MEP and MVA pathways and their evolutionary dynamics. 2021.Journal of Integrative Plant Biology63(7): 1211-1226.

Xiaojun Pu?, Zhuo Yang?, Yongjun Lin, Yaling Song, Zexi Chen, Silin Chen, Hong Yang, Liu Duan*, Li Liu*(2025). Integration of HDS and HSFA1 Functions in MEcPP-Mediated Thermotolerance and Growth Regulation in Physcomitrium Patens.Plant, Cell & Environment(in press).

Xiaojun Pu, Lina Liu, Ping Li, Heqiang Huo, Xiumei Dong, Kabin Xie, Hong Yang and Li Liu*(2019). A CRISPR/LbCas12a-based method for highly efficient multiplex gene editing in Physcomitrella patens.The Plant Journal100, 863-872.

Chen YL, Zhang L, Zhang H, Chen L, Yu D*(2021). ERF1 delays flowering through direct inhibition of FLOWERING LOCUS T expression in Arabidopsis.Journal of Integrative Plant Biology63: 1712-1723.

Xu Li+, Zhen Wang+, Sifan Sun+, et al(2024). IbNIEL-mediated degradation of IbNAC087 regulates JA-dependent salt and drought tolerance in sweet potato.Journal of Integrative Plant Biology66(2):176-195.

Lamei Zheng, Bojing Li, Genfa Zhang, Yijun Zhou, Fei Gao*(2024). Jasmonate enhances cold acclimation in jojoba by promoting flavonol synthesis.Horticulture Research11(7):uhae125.

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